La APM es una asociación de carácter científico y tiene como principales funciones y objetivos:

- Promover el estudio, la práctica y la investigación del psicoanálisis en México.

- Educar a sus candidatos en la aplicación del psicoanálisis con adultos, niños y adolescentes.

- Entrenar a sus socios titulares para la docencia, la investigación y la difusión del psicoanálisis.

- Formar, en su Centro de Estudios de Postgrado (C.E. P.), Psicoterapeutas con grado académico de Maestría en Psicoterapia General, Maestría en Psicoterapia Psicoanalítica de Niños y Adolescentes (sin reconocimiento oficial, con registro en trámite) y Doctorado en Psicoterapia.

- Ofrecer atención psicoanalítica y psicoterapéutica a la comunidad, a través de la Clínica del Instituto de Psicoanálisis.

- Difundir los conocimientos psicoanalíticos a través de un congreso anual, abierto a estudiantes y profesionistas en el campo de la salud mental.

- Editar semestralmente "Cuadernos de Psicoanálisis", órgano oficial de difusión.