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Las asignaturas básicas se seleccionan de acuerdo al tema particular de interés del estudiante, configurando su formación básica específica a su proyecto de investigación y a su futura especialidad de trabajo. Tienen un valor de 8 créditos cada una, y con ellas se deberán cubrir un total de 32 créditos. La lista de asignaturas básicas es la siguiente:
- Oceanografía Física
- Oceanografía Química
- Geología Marina
- Métodos de Investigación Oceanográfica
- Limnología
- Ecología Acuática
- Biología Marina
Biología Marina
- Sistemática, biología y ecología de los principales grupos de organismos marinos: fitoplancton, zooplancton, protozoarios, algas, pastos marinos, esponjas, poliquetos, equinodermos, moluscos, crustáceos y peces.
- Genética y evolución de organismos marinos.
- Ecofisiología y fotobiología de productores primarios.
- Ecofisiología y ecotoxicología de organismos acuáticos.
- Ecología de: sistemas lagunares, arrecifes coralinos, plataforma continental y mar profundo.
- Modelación ecologica de ecosistemas acuáticos
- Pesquerías y dinámica de poblaciones.
- Acuacultura, nutrición y patología de organismos acuáticos.
- Manejo de recursos marinos y costeros.